Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slc27a2O35488 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slc27a2O35488 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slc27a2O35488 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slc27a2O35488 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc27a2O35488 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms