Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Edil3O35474 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Edil3O35474 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Edil3O35474 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Edil3O35474 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Edil3O35474 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Edil3O35474 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms