Protein–RNA interactions for Protein: O35473

C1d, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1dO35473 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C1dO35473 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C1dO35473 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1dO35473 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1dO35473 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
C1dO35473 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1dO35473 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1dO35473 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1dO35473 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1dO35473 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1dO35473 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1dO35473 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1dO35473 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C1dO35473 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1dO35473 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1dO35473 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1dO35473 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1dO35473 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1dO35473 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1dO35473 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1dO35473 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1dO35473 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C1dO35473 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C1dO35473 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1dO35473 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
C1dO35473 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1dO35473 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1dO35473 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1dO35473 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1dO35473 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1dO35473 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1dO35473 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C1dO35473 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1dO35473 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1dO35473 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1dO35473 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1dO35473 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1dO35473 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1dO35473 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1dO35473 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1dO35473 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1dO35473 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1dO35473 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1dO35473 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1dO35473 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1dO35473 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1dO35473 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1dO35473 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1dO35473 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1dO35473 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1dO35473 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1dO35473 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1dO35473 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1dO35473 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1dO35473 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1dO35473 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1dO35473 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1dO35473 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1dO35473 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1dO35473 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1dO35473 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1dO35473 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1dO35473 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1dO35473 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1dO35473 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1dO35473 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1dO35473 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1dO35473 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1dO35473 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1dO35473 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1dO35473 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C1dO35473 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1dO35473 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1dO35473 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1dO35473 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1dO35473 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C1dO35473 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1dO35473 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C1dO35473 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1dO35473 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C1dO35473 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1dO35473 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1dO35473 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1dO35473 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1dO35473 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1dO35473 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1dO35473 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1dO35473 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1dO35473 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1dO35473 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1dO35473 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C1dO35473 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1dO35473 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1dO35473 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1dO35473 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1dO35473 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1dO35473 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1dO35473 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1dO35473 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1dO35473 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms