Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema6aO35464 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema6aO35464 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms