Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Xbp1O35426 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms