Protein–RNA interactions for Protein: O35350

Capn1, Calpain-1 catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn1O35350 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capn1O35350 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn1O35350 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn1O35350 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn1O35350 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn1O35350 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn1O35350 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn1O35350 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn1O35350 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn1O35350 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms