Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pkd2O35245 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Pkd2O35245 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pkd2O35245 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Pkd2O35245 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pkd2O35245 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pkd2O35245 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pkd2O35245 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pkd2O35245 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pkd2O35245 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pkd2O35245 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pkd2O35245 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pkd2O35245 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pkd2O35245 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pkd2O35245 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pkd2O35245 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pkd2O35245 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pkd2O35245 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pkd2O35245 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pkd2O35245 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pkd2O35245 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pkd2O35245 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pkd2O35245 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pkd2O35245 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pkd2O35245 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pkd2O35245 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pkd2O35245 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pkd2O35245 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pkd2O35245 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pkd2O35245 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pkd2O35245 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Pkd2O35245 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pkd2O35245 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pkd2O35245 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms