Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Bhlhe40O35185 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Bhlhe40O35185 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms