Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Polr1aO35134 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Polr1aO35134 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Polr1aO35134 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Polr1aO35134 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Polr1aO35134 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Polr1aO35134 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Polr1aO35134 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Polr1aO35134 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Polr1aO35134 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Polr1aO35134 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Polr1aO35134 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Polr1aO35134 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Polr1aO35134 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Polr1aO35134 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Polr1aO35134 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Polr1aO35134 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Polr1aO35134 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Polr1aO35134 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Polr1aO35134 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Polr1aO35134 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Polr1aO35134 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Polr1aO35134 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Polr1aO35134 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Polr1aO35134 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Polr1aO35134 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Polr1aO35134 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Polr1aO35134 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Polr1aO35134 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Polr1aO35134 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Polr1aO35134 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Polr1aO35134 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Polr1aO35134 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Polr1aO35134 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Polr1aO35134 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Polr1aO35134 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Polr1aO35134 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Polr1aO35134 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Polr1aO35134 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Polr1aO35134 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Polr1aO35134 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Polr1aO35134 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Polr1aO35134 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Polr1aO35134 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Polr1aO35134 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Polr1aO35134 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Polr1aO35134 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Polr1aO35134 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Polr1aO35134 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Polr1aO35134 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Polr1aO35134 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Polr1aO35134 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Polr1aO35134 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Polr1aO35134 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Polr1aO35134 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Polr1aO35134 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Polr1aO35134 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Polr1aO35134 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Polr1aO35134 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Polr1aO35134 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Polr1aO35134 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Polr1aO35134 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Polr1aO35134 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Polr1aO35134 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Polr1aO35134 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Polr1aO35134 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Polr1aO35134 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Polr1aO35134 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Polr1aO35134 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Polr1aO35134 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Polr1aO35134 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Polr1aO35134 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Polr1aO35134 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Polr1aO35134 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Polr1aO35134 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Polr1aO35134 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Polr1aO35134 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Polr1aO35134 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Polr1aO35134 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Polr1aO35134 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Polr1aO35134 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Polr1aO35134 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Polr1aO35134 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Polr1aO35134 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Polr1aO35134 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Polr1aO35134 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Polr1aO35134 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.5 ms