Protein–RNA interactions for Protein: O35089

Cnih2, Protein cornichon homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih2O35089 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnih2O35089 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnih2O35089 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnih2O35089 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms