Protein–RNA interactions for Protein: O35074

Ptgis, Prostacyclin synthase, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgisO35074 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtgisO35074 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtgisO35074 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtgisO35074 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtgisO35074 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PtgisO35074 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PtgisO35074 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PtgisO35074 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
PtgisO35074 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PtgisO35074 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtgisO35074 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtgisO35074 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PtgisO35074 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtgisO35074 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtgisO35074 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtgisO35074 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms