Protein–RNA interactions for Protein: O35066

Kif3c, Kinesin-like protein KIF3C, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3cO35066 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kif3cO35066 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kif3cO35066 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kif3cO35066 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kif3cO35066 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kif3cO35066 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kif3cO35066 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kif3cO35066 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kif3cO35066 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kif3cO35066 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kif3cO35066 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Kif3cO35066 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kif3cO35066 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kif3cO35066 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kif3cO35066 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kif3cO35066 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kif3cO35066 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kif3cO35066 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kif3cO35066 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kif3cO35066 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kif3cO35066 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kif3cO35066 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Kif3cO35066 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kif3cO35066 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kif3cO35066 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kif3cO35066 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kif3cO35066 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kif3cO35066 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kif3cO35066 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Kif3cO35066 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kif3cO35066 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kif3cO35066 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kif3cO35066 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kif3cO35066 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kif3cO35066 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kif3cO35066 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kif3cO35066 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kif3cO35066 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kif3cO35066 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kif3cO35066 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kif3cO35066 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Kif3cO35066 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kif3cO35066 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kif3cO35066 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Kif3cO35066 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Kif3cO35066 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Kif3cO35066 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Kif3cO35066 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Kif3cO35066 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kif3cO35066 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kif3cO35066 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Kif3cO35066 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kif3cO35066 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kif3cO35066 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kif3cO35066 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kif3cO35066 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kif3cO35066 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kif3cO35066 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kif3cO35066 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kif3cO35066 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kif3cO35066 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kif3cO35066 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kif3cO35066 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kif3cO35066 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kif3cO35066 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kif3cO35066 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kif3cO35066 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kif3cO35066 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kif3cO35066 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kif3cO35066 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kif3cO35066 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kif3cO35066 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kif3cO35066 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kif3cO35066 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kif3cO35066 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kif3cO35066 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kif3cO35066 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kif3cO35066 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kif3cO35066 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Kif3cO35066 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kif3cO35066 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kif3cO35066 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kif3cO35066 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kif3cO35066 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kif3cO35066 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kif3cO35066 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kif3cO35066 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kif3cO35066 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kif3cO35066 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kif3cO35066 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kif3cO35066 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kif3cO35066 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kif3cO35066 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kif3cO35066 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kif3cO35066 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Kif3cO35066 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kif3cO35066 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kif3cO35066 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kif3cO35066 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Kif3cO35066 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms