Protein–RNA interactions for Protein: O09044

Snap23, Synaptosomal-associated protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap23O09044 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snap23O09044 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snap23O09044 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snap23O09044 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snap23O09044 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snap23O09044 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snap23O09044 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snap23O09044 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snap23O09044 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snap23O09044 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snap23O09044 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snap23O09044 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snap23O09044 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snap23O09044 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snap23O09044 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snap23O09044 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snap23O09044 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snap23O09044 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snap23O09044 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snap23O09044 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snap23O09044 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snap23O09044 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snap23O09044 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snap23O09044 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snap23O09044 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snap23O09044 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snap23O09044 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snap23O09044 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snap23O09044 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Snap23O09044 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Snap23O09044 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snap23O09044 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Snap23O09044 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snap23O09044 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snap23O09044 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Snap23O09044 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Snap23O09044 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Snap23O09044 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Snap23O09044 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Snap23O09044 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Snap23O09044 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Snap23O09044 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Snap23O09044 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snap23O09044 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snap23O09044 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snap23O09044 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snap23O09044 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snap23O09044 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snap23O09044 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snap23O09044 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snap23O09044 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snap23O09044 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snap23O09044 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snap23O09044 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snap23O09044 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snap23O09044 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snap23O09044 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snap23O09044 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snap23O09044 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snap23O09044 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snap23O09044 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snap23O09044 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snap23O09044 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snap23O09044 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snap23O09044 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snap23O09044 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snap23O09044 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snap23O09044 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snap23O09044 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snap23O09044 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snap23O09044 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snap23O09044 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snap23O09044 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snap23O09044 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snap23O09044 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snap23O09044 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snap23O09044 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snap23O09044 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snap23O09044 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Snap23O09044 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snap23O09044 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Snap23O09044 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Snap23O09044 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snap23O09044 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snap23O09044 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snap23O09044 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snap23O09044 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snap23O09044 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Snap23O09044 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snap23O09044 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snap23O09044 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snap23O09044 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snap23O09044 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snap23O09044 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snap23O09044 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snap23O09044 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snap23O09044 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Snap23O09044 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snap23O09044 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snap23O09044 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms