Protein–RNA interactions for Protein: O08786

Cckar, Cholecystokinin receptor type A, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckarO08786 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CckarO08786 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CckarO08786 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CckarO08786 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CckarO08786 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CckarO08786 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CckarO08786 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CckarO08786 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CckarO08786 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CckarO08786 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CckarO08786 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CckarO08786 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CckarO08786 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CckarO08786 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CckarO08786 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CckarO08786 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CckarO08786 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CckarO08786 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CckarO08786 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CckarO08786 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CckarO08786 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CckarO08786 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CckarO08786 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CckarO08786 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CckarO08786 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CckarO08786 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CckarO08786 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CckarO08786 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CckarO08786 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CckarO08786 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CckarO08786 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CckarO08786 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CckarO08786 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CckarO08786 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CckarO08786 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CckarO08786 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CckarO08786 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CckarO08786 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CckarO08786 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CckarO08786 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CckarO08786 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CckarO08786 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CckarO08786 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CckarO08786 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CckarO08786 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CckarO08786 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CckarO08786 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CckarO08786 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CckarO08786 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CckarO08786 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CckarO08786 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CckarO08786 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CckarO08786 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CckarO08786 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CckarO08786 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CckarO08786 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CckarO08786 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CckarO08786 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CckarO08786 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CckarO08786 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CckarO08786 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CckarO08786 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CckarO08786 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CckarO08786 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CckarO08786 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CckarO08786 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CckarO08786 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CckarO08786 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CckarO08786 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CckarO08786 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CckarO08786 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CckarO08786 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CckarO08786 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CckarO08786 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CckarO08786 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CckarO08786 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CckarO08786 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CckarO08786 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CckarO08786 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CckarO08786 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CckarO08786 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CckarO08786 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CckarO08786 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CckarO08786 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CckarO08786 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CckarO08786 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CckarO08786 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CckarO08786 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CckarO08786 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CckarO08786 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CckarO08786 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CckarO08786 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CckarO08786 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CckarO08786 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CckarO08786 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CckarO08786 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CckarO08786 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CckarO08786 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CckarO08786 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CckarO08786 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms