Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MttpO08601 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MttpO08601 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MttpO08601 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MttpO08601 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MttpO08601 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MttpO08601 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MttpO08601 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MttpO08601 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MttpO08601 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MttpO08601 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MttpO08601 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MttpO08601 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MttpO08601 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MttpO08601 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MttpO08601 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MttpO08601 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MttpO08601 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MttpO08601 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MttpO08601 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MttpO08601 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MttpO08601 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MttpO08601 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MttpO08601 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MttpO08601 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MttpO08601 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MttpO08601 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MttpO08601 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MttpO08601 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MttpO08601 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MttpO08601 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MttpO08601 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MttpO08601 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MttpO08601 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MttpO08601 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MttpO08601 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MttpO08601 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MttpO08601 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MttpO08601 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MttpO08601 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MttpO08601 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MttpO08601 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MttpO08601 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MttpO08601 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MttpO08601 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MttpO08601 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MttpO08601 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MttpO08601 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
MttpO08601 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MttpO08601 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
MttpO08601 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MttpO08601 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MttpO08601 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MttpO08601 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MttpO08601 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MttpO08601 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MttpO08601 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MttpO08601 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MttpO08601 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MttpO08601 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MttpO08601 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MttpO08601 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MttpO08601 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MttpO08601 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MttpO08601 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MttpO08601 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MttpO08601 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MttpO08601 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MttpO08601 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MttpO08601 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MttpO08601 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
MttpO08601 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MttpO08601 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MttpO08601 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MttpO08601 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MttpO08601 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MttpO08601 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MttpO08601 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MttpO08601 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
MttpO08601 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
MttpO08601 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MttpO08601 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MttpO08601 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MttpO08601 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MttpO08601 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MttpO08601 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MttpO08601 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MttpO08601 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MttpO08601 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MttpO08601 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MttpO08601 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MttpO08601 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MttpO08601 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MttpO08601 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MttpO08601 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
MttpO08601 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MttpO08601 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
MttpO08601 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MttpO08601 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MttpO08601 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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