Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sec22bO08547 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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