Protein–RNA interactions for Protein: O08542

Efna4, Ephrin-A4, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna4O08542 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Efna4O08542 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efna4O08542 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efna4O08542 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efna4O08542 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efna4O08542 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efna4O08542 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efna4O08542 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efna4O08542 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efna4O08542 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efna4O08542 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efna4O08542 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Efna4O08542 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms