Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm2035J3QP87 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm2035J3QP87 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms