Protein–RNA interactions for Protein: J3QMI4

Calhm3, Calcium homeostasis modulator 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calhm3J3QMI4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Calhm3J3QMI4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Calhm3J3QMI4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Calhm3J3QMI4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Calhm3J3QMI4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Calhm3J3QMI4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Calhm3J3QMI4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Calhm3J3QMI4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Calhm3J3QMI4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Calhm3J3QMI4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Calhm3J3QMI4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Calhm3J3QMI4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms