Protein–RNA interactions for Protein: J3QM38

Zfp994, Zinc finger protein 994, mousemouse

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp994J3QM38 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Zfp994J3QM38 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp994J3QM38 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp994J3QM38 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp994J3QM38 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Zfp994J3QM38 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp994J3QM38 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp994J3QM38 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp994J3QM38 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp994J3QM38 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp994J3QM38 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp994J3QM38 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Zfp994J3QM38 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp994J3QM38 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp994J3QM38 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp994J3QM38 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp994J3QM38 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp994J3QM38 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp994J3QM38 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp994J3QM38 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp994J3QM38 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp994J3QM38 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp994J3QM38 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp994J3QM38 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp994J3QM38 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp994J3QM38 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp994J3QM38 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp994J3QM38 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp994J3QM38 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp994J3QM38 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp994J3QM38 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp994J3QM38 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp994J3QM38 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp994J3QM38 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp994J3QM38 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp994J3QM38 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp994J3QM38 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Zfp994J3QM38 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp994J3QM38 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp994J3QM38 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp994J3QM38 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp994J3QM38 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp994J3QM38 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zfp994J3QM38 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
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Zfp994J3QM38 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp994J3QM38 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp994J3QM38 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp994J3QM38 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp994J3QM38 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp994J3QM38 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp994J3QM38 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp994J3QM38 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Zfp994J3QM38 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Zfp994J3QM38 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Zfp994J3QM38 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Zfp994J3QM38 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp994J3QM38 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp994J3QM38 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp994J3QM38 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp994J3QM38 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp994J3QM38 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp994J3QM38 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp994J3QM38 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp994J3QM38 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zfp994J3QM38 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp994J3QM38 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp994J3QM38 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp994J3QM38 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp994J3QM38 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp994J3QM38 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp994J3QM38 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp994J3QM38 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp994J3QM38 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp994J3QM38 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp994J3QM38 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp994J3QM38 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp994J3QM38 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp994J3QM38 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp994J3QM38 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp994J3QM38 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zfp994J3QM38 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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