Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tubgcp6G5E8P0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tubgcp6G5E8P0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tubgcp6G5E8P0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tubgcp6G5E8P0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tubgcp6G5E8P0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tubgcp6G5E8P0 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tubgcp6G5E8P0 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tubgcp6G5E8P0 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tubgcp6G5E8P0 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tubgcp6G5E8P0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Tubgcp6G5E8P0 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tubgcp6G5E8P0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tubgcp6G5E8P0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tubgcp6G5E8P0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tubgcp6G5E8P0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tubgcp6G5E8P0 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tubgcp6G5E8P0 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tubgcp6G5E8P0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tubgcp6G5E8P0 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tubgcp6G5E8P0 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tubgcp6G5E8P0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tubgcp6G5E8P0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tubgcp6G5E8P0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tubgcp6G5E8P0 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Tubgcp6G5E8P0 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Tubgcp6G5E8P0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tubgcp6G5E8P0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tubgcp6G5E8P0 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tubgcp6G5E8P0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tubgcp6G5E8P0 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tubgcp6G5E8P0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tubgcp6G5E8P0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tubgcp6G5E8P0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tubgcp6G5E8P0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tubgcp6G5E8P0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tubgcp6G5E8P0 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tubgcp6G5E8P0 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tubgcp6G5E8P0 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tubgcp6G5E8P0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tubgcp6G5E8P0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tubgcp6G5E8P0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tubgcp6G5E8P0 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tubgcp6G5E8P0 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tubgcp6G5E8P0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tubgcp6G5E8P0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tubgcp6G5E8P0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tubgcp6G5E8P0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tubgcp6G5E8P0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tubgcp6G5E8P0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tubgcp6G5E8P0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tubgcp6G5E8P0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tubgcp6G5E8P0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tubgcp6G5E8P0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tubgcp6G5E8P0 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tubgcp6G5E8P0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tubgcp6G5E8P0 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tubgcp6G5E8P0 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tubgcp6G5E8P0 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Tubgcp6G5E8P0 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Tubgcp6G5E8P0 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tubgcp6G5E8P0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tubgcp6G5E8P0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tubgcp6G5E8P0 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tubgcp6G5E8P0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tubgcp6G5E8P0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tubgcp6G5E8P0 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tubgcp6G5E8P0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tubgcp6G5E8P0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tubgcp6G5E8P0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tubgcp6G5E8P0 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tubgcp6G5E8P0 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Tubgcp6G5E8P0 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Tubgcp6G5E8P0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tubgcp6G5E8P0 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tubgcp6G5E8P0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tubgcp6G5E8P0 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tubgcp6G5E8P0 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tubgcp6G5E8P0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tubgcp6G5E8P0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tubgcp6G5E8P0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tubgcp6G5E8P0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tubgcp6G5E8P0 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Tubgcp6G5E8P0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tubgcp6G5E8P0 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tubgcp6G5E8P0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tubgcp6G5E8P0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tubgcp6G5E8P0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tubgcp6G5E8P0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tubgcp6G5E8P0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tubgcp6G5E8P0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tubgcp6G5E8P0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tubgcp6G5E8P0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tubgcp6G5E8P0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tubgcp6G5E8P0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tubgcp6G5E8P0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tubgcp6G5E8P0 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tubgcp6G5E8P0 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Tubgcp6G5E8P0 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Tubgcp6G5E8P0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms