Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pcf11G3X9Z4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pcf11G3X9Z4 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pcf11G3X9Z4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pcf11G3X9Z4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pcf11G3X9Z4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pcf11G3X9Z4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pcf11G3X9Z4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pcf11G3X9Z4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pcf11G3X9Z4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pcf11G3X9Z4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pcf11G3X9Z4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pcf11G3X9Z4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pcf11G3X9Z4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pcf11G3X9Z4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pcf11G3X9Z4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pcf11G3X9Z4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pcf11G3X9Z4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pcf11G3X9Z4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pcf11G3X9Z4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pcf11G3X9Z4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pcf11G3X9Z4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pcf11G3X9Z4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pcf11G3X9Z4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pcf11G3X9Z4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pcf11G3X9Z4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pcf11G3X9Z4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pcf11G3X9Z4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pcf11G3X9Z4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pcf11G3X9Z4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pcf11G3X9Z4 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Pcf11G3X9Z4 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pcf11G3X9Z4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pcf11G3X9Z4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pcf11G3X9Z4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pcf11G3X9Z4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pcf11G3X9Z4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pcf11G3X9Z4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pcf11G3X9Z4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pcf11G3X9Z4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pcf11G3X9Z4 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pcf11G3X9Z4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Pcf11G3X9Z4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pcf11G3X9Z4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Pcf11G3X9Z4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Pcf11G3X9Z4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Pcf11G3X9Z4 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pcf11G3X9Z4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pcf11G3X9Z4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pcf11G3X9Z4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pcf11G3X9Z4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pcf11G3X9Z4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pcf11G3X9Z4 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pcf11G3X9Z4 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pcf11G3X9Z4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pcf11G3X9Z4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Pcf11G3X9Z4 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pcf11G3X9Z4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pcf11G3X9Z4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pcf11G3X9Z4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pcf11G3X9Z4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pcf11G3X9Z4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Pcf11G3X9Z4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Pcf11G3X9Z4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Pcf11G3X9Z4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Pcf11G3X9Z4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Pcf11G3X9Z4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pcf11G3X9Z4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pcf11G3X9Z4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pcf11G3X9Z4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pcf11G3X9Z4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pcf11G3X9Z4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pcf11G3X9Z4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pcf11G3X9Z4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Pcf11G3X9Z4 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pcf11G3X9Z4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pcf11G3X9Z4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pcf11G3X9Z4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pcf11G3X9Z4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pcf11G3X9Z4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pcf11G3X9Z4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pcf11G3X9Z4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pcf11G3X9Z4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pcf11G3X9Z4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pcf11G3X9Z4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pcf11G3X9Z4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pcf11G3X9Z4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pcf11G3X9Z4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pcf11G3X9Z4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pcf11G3X9Z4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pcf11G3X9Z4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pcf11G3X9Z4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pcf11G3X9Z4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pcf11G3X9Z4 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Pcf11G3X9Z4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pcf11G3X9Z4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pcf11G3X9Z4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pcf11G3X9Z4 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pcf11G3X9Z4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pcf11G3X9Z4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms