Protein–RNA interactions for Protein: G3UZF1

Gm20509, Predicted gene 20509 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20509G3UZF1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20509G3UZF1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20509G3UZF1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20509G3UZF1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20509G3UZF1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20509G3UZF1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20509G3UZF1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20509G3UZF1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20509G3UZF1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20509G3UZF1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20509G3UZF1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20509G3UZF1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20509G3UZF1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20509G3UZF1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20509G3UZF1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20509G3UZF1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20509G3UZF1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20509G3UZF1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20509G3UZF1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20509G3UZF1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20509G3UZF1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20509G3UZF1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20509G3UZF1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20509G3UZF1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20509G3UZF1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20509G3UZF1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20509G3UZF1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20509G3UZF1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20509G3UZF1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20509G3UZF1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20509G3UZF1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20509G3UZF1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20509G3UZF1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20509G3UZF1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20509G3UZF1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20509G3UZF1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20509G3UZF1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20509G3UZF1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20509G3UZF1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gm20509G3UZF1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gm20509G3UZF1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20509G3UZF1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20509G3UZF1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20509G3UZF1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20509G3UZF1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20509G3UZF1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20509G3UZF1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20509G3UZF1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20509G3UZF1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20509G3UZF1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20509G3UZF1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20509G3UZF1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20509G3UZF1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20509G3UZF1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20509G3UZF1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20509G3UZF1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20509G3UZF1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20509G3UZF1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20509G3UZF1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20509G3UZF1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20509G3UZF1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20509G3UZF1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20509G3UZF1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20509G3UZF1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20509G3UZF1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20509G3UZF1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20509G3UZF1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20509G3UZF1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20509G3UZF1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20509G3UZF1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20509G3UZF1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20509G3UZF1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20509G3UZF1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20509G3UZF1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20509G3UZF1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20509G3UZF1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20509G3UZF1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20509G3UZF1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20509G3UZF1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20509G3UZF1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20509G3UZF1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20509G3UZF1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20509G3UZF1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20509G3UZF1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20509G3UZF1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20509G3UZF1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20509G3UZF1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20509G3UZF1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20509G3UZF1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20509G3UZF1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20509G3UZF1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20509G3UZF1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20509G3UZF1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20509G3UZF1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20509G3UZF1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20509G3UZF1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20509G3UZF1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20509G3UZF1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20509G3UZF1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm20509G3UZF1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms