Protein–RNA interactions for Protein: G3UXD1

Speer4c, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4cG3UXD1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms