Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cldn34aG3UW52 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cldn34aG3UW52 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms