Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
XntrpcF8VQM8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
XntrpcF8VQM8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
XntrpcF8VQM8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
XntrpcF8VQM8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
XntrpcF8VQM8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
XntrpcF8VQM8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
XntrpcF8VQM8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
XntrpcF8VQM8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
XntrpcF8VQM8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
XntrpcF8VQM8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
XntrpcF8VQM8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
XntrpcF8VQM8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
XntrpcF8VQM8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
XntrpcF8VQM8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
XntrpcF8VQM8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
XntrpcF8VQM8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
XntrpcF8VQM8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
XntrpcF8VQM8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
XntrpcF8VQM8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
XntrpcF8VQM8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
XntrpcF8VQM8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
XntrpcF8VQM8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
XntrpcF8VQM8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
XntrpcF8VQM8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
XntrpcF8VQM8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
XntrpcF8VQM8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
XntrpcF8VQM8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
XntrpcF8VQM8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
XntrpcF8VQM8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
XntrpcF8VQM8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
XntrpcF8VQM8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
XntrpcF8VQM8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
XntrpcF8VQM8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
XntrpcF8VQM8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms