Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Srp72F8VQC1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Srp72F8VQC1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Srp72F8VQC1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Srp72F8VQC1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Srp72F8VQC1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Srp72F8VQC1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Srp72F8VQC1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Srp72F8VQC1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Srp72F8VQC1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Srp72F8VQC1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Srp72F8VQC1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Srp72F8VQC1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Srp72F8VQC1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Srp72F8VQC1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Srp72F8VQC1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Srp72F8VQC1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Srp72F8VQC1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Srp72F8VQC1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Srp72F8VQC1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Srp72F8VQC1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Srp72F8VQC1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Srp72F8VQC1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Srp72F8VQC1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Srp72F8VQC1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Srp72F8VQC1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Srp72F8VQC1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Srp72F8VQC1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Srp72F8VQC1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Srp72F8VQC1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Srp72F8VQC1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Srp72F8VQC1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Srp72F8VQC1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Srp72F8VQC1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Srp72F8VQC1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Srp72F8VQC1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Srp72F8VQC1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Srp72F8VQC1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Srp72F8VQC1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Srp72F8VQC1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Srp72F8VQC1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Srp72F8VQC1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Srp72F8VQC1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Srp72F8VQC1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Srp72F8VQC1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Srp72F8VQC1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Srp72F8VQC1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Srp72F8VQC1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Srp72F8VQC1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Srp72F8VQC1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Srp72F8VQC1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Srp72F8VQC1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Srp72F8VQC1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Srp72F8VQC1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Srp72F8VQC1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Srp72F8VQC1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Srp72F8VQC1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Srp72F8VQC1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Srp72F8VQC1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Srp72F8VQC1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Srp72F8VQC1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Srp72F8VQC1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Srp72F8VQC1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Srp72F8VQC1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Srp72F8VQC1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Srp72F8VQC1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Srp72F8VQC1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Srp72F8VQC1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Srp72F8VQC1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Srp72F8VQC1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Srp72F8VQC1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Srp72F8VQC1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Srp72F8VQC1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Srp72F8VQC1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
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