Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
ScaperF8VQ70 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ScaperF8VQ70 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ScaperF8VQ70 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ScaperF8VQ70 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ScaperF8VQ70 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ScaperF8VQ70 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ScaperF8VQ70 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ScaperF8VQ70 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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