Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp9yF8VPU6 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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