Protein–RNA interactions for Protein: F8VPQ2

Arid4a, AT-rich interactive domain 4A (RBP1-like), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid4aF8VPQ2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Arid4aF8VPQ2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Arid4aF8VPQ2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Arid4aF8VPQ2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Arid4aF8VPQ2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Arid4aF8VPQ2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Arid4aF8VPQ2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Arid4aF8VPQ2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arid4aF8VPQ2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arid4aF8VPQ2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arid4aF8VPQ2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arid4aF8VPQ2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arid4aF8VPQ2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arid4aF8VPQ2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arid4aF8VPQ2 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arid4aF8VPQ2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arid4aF8VPQ2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arid4aF8VPQ2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arid4aF8VPQ2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arid4aF8VPQ2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arid4aF8VPQ2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arid4aF8VPQ2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Arid4aF8VPQ2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arid4aF8VPQ2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arid4aF8VPQ2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arid4aF8VPQ2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arid4aF8VPQ2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arid4aF8VPQ2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arid4aF8VPQ2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arid4aF8VPQ2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arid4aF8VPQ2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arid4aF8VPQ2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arid4aF8VPQ2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arid4aF8VPQ2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arid4aF8VPQ2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arid4aF8VPQ2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arid4aF8VPQ2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arid4aF8VPQ2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arid4aF8VPQ2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arid4aF8VPQ2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arid4aF8VPQ2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arid4aF8VPQ2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arid4aF8VPQ2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arid4aF8VPQ2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Arid4aF8VPQ2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Arid4aF8VPQ2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Arid4aF8VPQ2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Arid4aF8VPQ2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Arid4aF8VPQ2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Arid4aF8VPQ2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Arid4aF8VPQ2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Arid4aF8VPQ2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Arid4aF8VPQ2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Arid4aF8VPQ2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Arid4aF8VPQ2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Arid4aF8VPQ2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Arid4aF8VPQ2 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Arid4aF8VPQ2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Arid4aF8VPQ2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Arid4aF8VPQ2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms