Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

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Length 633 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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Zfp988F6VKC7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Zfp988F6VKC7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Zfp988F6VKC7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Zfp988F6VKC7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Zfp988F6VKC7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Zfp988F6VKC7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp988F6VKC7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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