Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm28305F6U473 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm28305F6U473 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm28305F6U473 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm28305F6U473 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm28305F6U473 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm28305F6U473 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm28305F6U473 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm28305F6U473 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm28305F6U473 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm28305F6U473 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm28305F6U473 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm28305F6U473 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm28305F6U473 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm28305F6U473 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm28305F6U473 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm28305F6U473 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm28305F6U473 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm28305F6U473 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm28305F6U473 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm28305F6U473 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm28305F6U473 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm28305F6U473 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm28305F6U473 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm28305F6U473 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm28305F6U473 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm28305F6U473 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm28305F6U473 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm28305F6U473 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm28305F6U473 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm28305F6U473 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm28305F6U473 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm28305F6U473 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm28305F6U473 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm28305F6U473 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm28305F6U473 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm28305F6U473 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm28305F6U473 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm28305F6U473 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm28305F6U473 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm28305F6U473 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm28305F6U473 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm28305F6U473 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm28305F6U473 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm28305F6U473 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm28305F6U473 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm28305F6U473 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm28305F6U473 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm28305F6U473 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm28305F6U473 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm28305F6U473 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm28305F6U473 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm28305F6U473 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm28305F6U473 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm28305F6U473 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28305F6U473 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28305F6U473 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28305F6U473 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28305F6U473 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28305F6U473 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28305F6U473 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28305F6U473 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28305F6U473 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28305F6U473 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28305F6U473 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28305F6U473 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28305F6U473 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28305F6U473 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm28305F6U473 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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