Protein–RNA interactions for Protein: F6U3N7

Gm21977, Predicted gene 21977 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21977F6U3N7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21977F6U3N7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21977F6U3N7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21977F6U3N7 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm21977F6U3N7 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21977F6U3N7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21977F6U3N7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21977F6U3N7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21977F6U3N7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21977F6U3N7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21977F6U3N7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21977F6U3N7 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21977F6U3N7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21977F6U3N7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21977F6U3N7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21977F6U3N7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21977F6U3N7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21977F6U3N7 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21977F6U3N7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21977F6U3N7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21977F6U3N7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21977F6U3N7 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21977F6U3N7 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21977F6U3N7 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21977F6U3N7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21977F6U3N7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21977F6U3N7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21977F6U3N7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21977F6U3N7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm21977F6U3N7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21977F6U3N7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21977F6U3N7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21977F6U3N7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21977F6U3N7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21977F6U3N7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21977F6U3N7 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21977F6U3N7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21977F6U3N7 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21977F6U3N7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21977F6U3N7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21977F6U3N7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21977F6U3N7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21977F6U3N7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21977F6U3N7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21977F6U3N7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21977F6U3N7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm21977F6U3N7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21977F6U3N7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21977F6U3N7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21977F6U3N7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21977F6U3N7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21977F6U3N7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21977F6U3N7 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm21977F6U3N7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm21977F6U3N7 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm21977F6U3N7 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm21977F6U3N7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm21977F6U3N7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm21977F6U3N7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm21977F6U3N7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm21977F6U3N7 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm21977F6U3N7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm21977F6U3N7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm21977F6U3N7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm21977F6U3N7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm21977F6U3N7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm21977F6U3N7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm21977F6U3N7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm21977F6U3N7 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm21977F6U3N7 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm21977F6U3N7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm21977F6U3N7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm21977F6U3N7 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm21977F6U3N7 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm21977F6U3N7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm21977F6U3N7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21977F6U3N7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21977F6U3N7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21977F6U3N7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21977F6U3N7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21977F6U3N7 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21977F6U3N7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21977F6U3N7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21977F6U3N7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21977F6U3N7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21977F6U3N7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21977F6U3N7 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21977F6U3N7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21977F6U3N7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21977F6U3N7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21977F6U3N7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21977F6U3N7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21977F6U3N7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21977F6U3N7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21977F6U3N7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21977F6U3N7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21977F6U3N7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21977F6U3N7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21977F6U3N7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm21977F6U3N7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms