Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syngap1F6SEU4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syngap1F6SEU4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms