Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm340F6RGI3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm340F6RGI3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms