Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cald1E9QA15 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cald1E9QA15 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms