Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

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Length 693 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TrdnE9Q9K5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TrdnE9Q9K5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TrdnE9Q9K5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TrdnE9Q9K5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TrdnE9Q9K5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TrdnE9Q9K5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TrdnE9Q9K5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TrdnE9Q9K5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TrdnE9Q9K5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TrdnE9Q9K5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TrdnE9Q9K5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TrdnE9Q9K5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TrdnE9Q9K5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TrdnE9Q9K5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TrdnE9Q9K5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TrdnE9Q9K5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TrdnE9Q9K5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TrdnE9Q9K5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TrdnE9Q9K5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TrdnE9Q9K5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
TrdnE9Q9K5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TrdnE9Q9K5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TrdnE9Q9K5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TrdnE9Q9K5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TrdnE9Q9K5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TrdnE9Q9K5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TrdnE9Q9K5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TrdnE9Q9K5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TrdnE9Q9K5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TrdnE9Q9K5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TrdnE9Q9K5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TrdnE9Q9K5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TrdnE9Q9K5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TrdnE9Q9K5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TrdnE9Q9K5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TrdnE9Q9K5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TrdnE9Q9K5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TrdnE9Q9K5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TrdnE9Q9K5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TrdnE9Q9K5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TrdnE9Q9K5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TrdnE9Q9K5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TrdnE9Q9K5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TrdnE9Q9K5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TrdnE9Q9K5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TrdnE9Q9K5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TrdnE9Q9K5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TrdnE9Q9K5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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TrdnE9Q9K5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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TrdnE9Q9K5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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TrdnE9Q9K5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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TrdnE9Q9K5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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TrdnE9Q9K5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TrdnE9Q9K5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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