Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Simc1E9Q6E9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Simc1E9Q6E9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Simc1E9Q6E9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Simc1E9Q6E9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Simc1E9Q6E9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Simc1E9Q6E9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Simc1E9Q6E9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Simc1E9Q6E9 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Simc1E9Q6E9 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Simc1E9Q6E9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Simc1E9Q6E9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Simc1E9Q6E9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Simc1E9Q6E9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Simc1E9Q6E9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Simc1E9Q6E9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Simc1E9Q6E9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Simc1E9Q6E9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Simc1E9Q6E9 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Simc1E9Q6E9 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Simc1E9Q6E9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Simc1E9Q6E9 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Simc1E9Q6E9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Simc1E9Q6E9 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Simc1E9Q6E9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Simc1E9Q6E9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Simc1E9Q6E9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Simc1E9Q6E9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Simc1E9Q6E9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Simc1E9Q6E9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Simc1E9Q6E9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Simc1E9Q6E9 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Simc1E9Q6E9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Simc1E9Q6E9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Simc1E9Q6E9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Simc1E9Q6E9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Simc1E9Q6E9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Simc1E9Q6E9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Simc1E9Q6E9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Simc1E9Q6E9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Simc1E9Q6E9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Simc1E9Q6E9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Simc1E9Q6E9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Simc1E9Q6E9 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Simc1E9Q6E9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Simc1E9Q6E9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Simc1E9Q6E9 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Simc1E9Q6E9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Simc1E9Q6E9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Simc1E9Q6E9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Simc1E9Q6E9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Simc1E9Q6E9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Simc1E9Q6E9 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Simc1E9Q6E9 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Simc1E9Q6E9 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Simc1E9Q6E9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Simc1E9Q6E9 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Simc1E9Q6E9 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Simc1E9Q6E9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Simc1E9Q6E9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Simc1E9Q6E9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Simc1E9Q6E9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Simc1E9Q6E9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Simc1E9Q6E9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Simc1E9Q6E9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Simc1E9Q6E9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Simc1E9Q6E9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Simc1E9Q6E9 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Simc1E9Q6E9 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Simc1E9Q6E9 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Simc1E9Q6E9 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Simc1E9Q6E9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Simc1E9Q6E9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Simc1E9Q6E9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Simc1E9Q6E9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Simc1E9Q6E9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Simc1E9Q6E9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Simc1E9Q6E9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Simc1E9Q6E9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Simc1E9Q6E9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Simc1E9Q6E9 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Simc1E9Q6E9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Simc1E9Q6E9 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Simc1E9Q6E9 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Simc1E9Q6E9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Simc1E9Q6E9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Simc1E9Q6E9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Simc1E9Q6E9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Simc1E9Q6E9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Simc1E9Q6E9 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Simc1E9Q6E9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Simc1E9Q6E9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Simc1E9Q6E9 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Simc1E9Q6E9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Simc1E9Q6E9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Simc1E9Q6E9 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Simc1E9Q6E9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Simc1E9Q6E9 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Simc1E9Q6E9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Simc1E9Q6E9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms