Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5Z5

Fancf, Fanconi anemia group F protein, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancfE9Q5Z5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FancfE9Q5Z5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FancfE9Q5Z5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FancfE9Q5Z5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FancfE9Q5Z5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FancfE9Q5Z5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FancfE9Q5Z5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FancfE9Q5Z5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FancfE9Q5Z5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FancfE9Q5Z5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FancfE9Q5Z5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FancfE9Q5Z5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FancfE9Q5Z5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FancfE9Q5Z5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FancfE9Q5Z5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FancfE9Q5Z5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FancfE9Q5Z5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FancfE9Q5Z5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FancfE9Q5Z5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FancfE9Q5Z5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FancfE9Q5Z5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FancfE9Q5Z5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FancfE9Q5Z5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FancfE9Q5Z5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FancfE9Q5Z5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FancfE9Q5Z5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FancfE9Q5Z5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FancfE9Q5Z5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FancfE9Q5Z5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FancfE9Q5Z5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FancfE9Q5Z5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FancfE9Q5Z5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FancfE9Q5Z5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FancfE9Q5Z5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FancfE9Q5Z5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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FancfE9Q5Z5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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FancfE9Q5Z5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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FancfE9Q5Z5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FancfE9Q5Z5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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FancfE9Q5Z5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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FancfE9Q5Z5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FancfE9Q5Z5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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FancfE9Q5Z5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FancfE9Q5Z5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FancfE9Q5Z5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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FancfE9Q5Z5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FancfE9Q5Z5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FancfE9Q5Z5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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FancfE9Q5Z5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FancfE9Q5Z5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FancfE9Q5Z5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FancfE9Q5Z5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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FancfE9Q5Z5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FancfE9Q5Z5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
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FancfE9Q5Z5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FancfE9Q5Z5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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FancfE9Q5Z5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FancfE9Q5Z5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FancfE9Q5Z5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FancfE9Q5Z5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FancfE9Q5Z5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FancfE9Q5Z5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FancfE9Q5Z5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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