Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
DspE9Q557 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DspE9Q557 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DspE9Q557 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DspE9Q557 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DspE9Q557 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
DspE9Q557 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DspE9Q557 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DspE9Q557 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
DspE9Q557 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DspE9Q557 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DspE9Q557 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DspE9Q557 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DspE9Q557 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DspE9Q557 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DspE9Q557 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DspE9Q557 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DspE9Q557 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DspE9Q557 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DspE9Q557 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DspE9Q557 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DspE9Q557 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DspE9Q557 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
DspE9Q557 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DspE9Q557 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DspE9Q557 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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