Protein–RNA interactions for Protein: E9Q492

Pgbd1, PiggyBac transposable element-derived 1, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgbd1E9Q492 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pgbd1E9Q492 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pgbd1E9Q492 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pgbd1E9Q492 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pgbd1E9Q492 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pgbd1E9Q492 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pgbd1E9Q492 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pgbd1E9Q492 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pgbd1E9Q492 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pgbd1E9Q492 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pgbd1E9Q492 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pgbd1E9Q492 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pgbd1E9Q492 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pgbd1E9Q492 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pgbd1E9Q492 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pgbd1E9Q492 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pgbd1E9Q492 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pgbd1E9Q492 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pgbd1E9Q492 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pgbd1E9Q492 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pgbd1E9Q492 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pgbd1E9Q492 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pgbd1E9Q492 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pgbd1E9Q492 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pgbd1E9Q492 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pgbd1E9Q492 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pgbd1E9Q492 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pgbd1E9Q492 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pgbd1E9Q492 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pgbd1E9Q492 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pgbd1E9Q492 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pgbd1E9Q492 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pgbd1E9Q492 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pgbd1E9Q492 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pgbd1E9Q492 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pgbd1E9Q492 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pgbd1E9Q492 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pgbd1E9Q492 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pgbd1E9Q492 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pgbd1E9Q492 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms