Protein–RNA interactions for Protein: E9Q411

Nbas, Neuroblastoma-amplified sequence, mousemouse

Predictions only

Length 2,356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NbasE9Q411 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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NbasE9Q411 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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NbasE9Q411 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NbasE9Q411 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms