Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
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