Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lrp3E9Q1T6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lrp3E9Q1T6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms