Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3095E9Q058 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm3095E9Q058 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms