Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fndc1E9Q043 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fndc1E9Q043 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fndc1E9Q043 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Fndc1E9Q043 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fndc1E9Q043 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fndc1E9Q043 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fndc1E9Q043 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fndc1E9Q043 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fndc1E9Q043 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fndc1E9Q043 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fndc1E9Q043 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fndc1E9Q043 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Fndc1E9Q043 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fndc1E9Q043 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fndc1E9Q043 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fndc1E9Q043 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Fndc1E9Q043 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Fndc1E9Q043 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Fndc1E9Q043 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fndc1E9Q043 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fndc1E9Q043 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fndc1E9Q043 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Fndc1E9Q043 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fndc1E9Q043 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fndc1E9Q043 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fndc1E9Q043 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fndc1E9Q043 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Fndc1E9Q043 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fndc1E9Q043 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fndc1E9Q043 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fndc1E9Q043 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fndc1E9Q043 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fndc1E9Q043 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fndc1E9Q043 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fndc1E9Q043 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fndc1E9Q043 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fndc1E9Q043 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Fndc1E9Q043 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fndc1E9Q043 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fndc1E9Q043 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fndc1E9Q043 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fndc1E9Q043 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fndc1E9Q043 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fndc1E9Q043 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Fndc1E9Q043 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Fndc1E9Q043 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Fndc1E9Q043 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fndc1E9Q043 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fndc1E9Q043 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Fndc1E9Q043 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fndc1E9Q043 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Fndc1E9Q043 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fndc1E9Q043 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fndc1E9Q043 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Fndc1E9Q043 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Fndc1E9Q043 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fndc1E9Q043 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Fndc1E9Q043 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fndc1E9Q043 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fndc1E9Q043 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fndc1E9Q043 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fndc1E9Q043 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fndc1E9Q043 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fndc1E9Q043 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fndc1E9Q043 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fndc1E9Q043 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fndc1E9Q043 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fndc1E9Q043 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fndc1E9Q043 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fndc1E9Q043 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fndc1E9Q043 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fndc1E9Q043 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fndc1E9Q043 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fndc1E9Q043 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fndc1E9Q043 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fndc1E9Q043 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fndc1E9Q043 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Fndc1E9Q043 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fndc1E9Q043 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fndc1E9Q043 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fndc1E9Q043 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fndc1E9Q043 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fndc1E9Q043 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fndc1E9Q043 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fndc1E9Q043 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Fndc1E9Q043 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fndc1E9Q043 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fndc1E9Q043 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fndc1E9Q043 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fndc1E9Q043 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fndc1E9Q043 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fndc1E9Q043 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fndc1E9Q043 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fndc1E9Q043 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Fndc1E9Q043 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fndc1E9Q043 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fndc1E9Q043 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fndc1E9Q043 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Fndc1E9Q043 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms