Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Brd1E9PZ26 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Brd1E9PZ26 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms