Protein–RNA interactions for Protein: E9PX29

Sptbn4, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn4E9PX29 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sptbn4E9PX29 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sptbn4E9PX29 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms