Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gm3002E9PW72 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms