Protein–RNA interactions for Protein: E9PV48

Ifit3b, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3B, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit3bE9PV48 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifit3bE9PV48 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms